Open Source Software

Una interesante lista de software open source para Windows
http://www.opensourcewindows.org/

Unos cuantos para Linux / Windows
http://ubuntulinuxhelp.com/top-100-of-the-best-useful-opensource-applications/

Recursos Open Source para Desarrolladores Web
http://www.webappers.com/

Java

Un par de ejemplos de java que me parecen interesante para comenzar con el lenguaje:

Building a Java Desktop Database Application
http://www.netbeans.org/kb/60/java/gui-db.html

BluePrints de Sun
http://java.sun.com/reference/blueprints/

Iré agregando otros links a medida vaya encontrando...